La symbiose est une association durable et à bénéfice réciproque entre deux espèces.
L'association de la bactérie « rhizobium » avec le lupin permet à cette plante de mieux assimiler les sels minéraux riches en azote. En échange la plante fournit à ces bactéries du sucre et une protection. C’est un échange réciproque. Les zones où le rhizobium s’installe, gonflent et forment une « nodosité ».
On observe aussi des mycorhizes, association d’un champignon et d’une plante. En développant un réseau de filaments connecté aux racines, le champignon favorise l’absorption racinaire en augmentant la surface d’échange de l’arbre avec le sol ce qui augmente la croissance de ce végétal. Le champignon quant à lui bénéficie du sucre produit par la plante. 85% des végétaux développent des mycorhizes.
On distingue les filaments du mycélium (champignon) autour de cette petite extrémité de racine.